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Enregistrement W2148885458 · doi:10.1093/glycob/cwm095

Sulfatide binding properties of murine and human antiganglioside antibodies

2007· article· en· W2148885458 sur OpenAlexaff
Kate Townson, Kay N Greenshields, Jean Veitch, Dawn Nicholl, Matthias Eckhardt, Oxana Galanina, Nicolai V. Bovin, Eric Samain, Tatiana Antoine, David R. Bundle, Ping Zhang, Chang Chun Ling, Hugh J Willison

Notice bibliographique

RevueGlycobiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésGlycanGangliosideAntibodyEpitopeChemistryAntigenBiochemistryGalactoseMolecular biologyBiologyGlycoproteinImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Antiganglioside antibodies form an important component of the innate and adaptive B cell repertoire, where they provide antimicrobial activity through binding encapsulated bacterial glycans. In an aberrant role, they target peripheral nerve gangliosides to induce autoimmune nerve injury. An important characteristic of antiganglioside antibodies is their ability to selectively recognize highly defined glycan structures. Since sialylated and sulfated glycans often share lectin recognition patterns, we here explored the possibility that certain antiganglioside antibodies might also bind 3-O-sulfo-beta-D-galactosylceramide (sulfatide), an abundant constituent of plasma and peripheral nerve myelin, that could thereby influence any immunoregulatory or autoimmune properties. Out of 25 antiganglioside antibodies screened in solid phase assays, 20 also bound sulfatide (10(-5) to 10(-6) M range) in addition to their favored ganglioside glycan epitope ( approximately 10(-7) M range). Solution inhibition studies demonstrated competition between ganglioside and sulfatide, indicating close proximity or sharing of the antigen binding variable region domain. Sulfatide and 3-O-sulfo-beta-D-galactose were unique in having this property amongst a wide range of sulfated glycans screened, including 4- and 6-O-sulfo-beta-D-galactose analogues. Antiganglioside antibody binding to 3-O-sulfo-beta-D-galactose was highly dependent upon the spatial presentation of the ligand, being completely inhibited by conjugation to protein or polyacrylamide (PAA) matrices. Binding was also absent when sulfatide was incorporated into plasma membranes, including myelin, under conditions in which antibody binding to ganglioside was retained. These data demonstrate that sulfatide binding is a common property of antiganglioside antibodies that may provide functional insights into, and consequences for this component of the innate immune repertoire.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,398

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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