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Enregistrement W2148920724 · doi:10.1105/tpc.113.113183

Comparing the Calcium Binding Abilities of Two Soybean Calmodulins: Towards Understanding the Divergent Nature of Plant Calmodulins

2013· article· en· W2148920724 sur OpenAlexaff
Jessica L. Gifford, Mostafa Jamshidiha, Jianhua Mo, H. Ishida, H. J. Vogel

Notice bibliographique

RevueThe Plant Cell · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Micronutrient Interactions and Effects
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCalmodulinBiologyCalciumGene isoformBiochemistryBiophysicsDissociation constantReceptorChemistryGeneEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The discovery that plants contain multiple calmodulin (CaM) isoforms of variable sequence identity to animal CaM suggested an additional level of sophistication in the intracellular role of calcium regulation in plants. Past research has focused on the ability of conserved or divergent plant CaM isoforms to activate both mammalian and plant protein targets. At present, however, not much is known about how these isoforms respond to the signal of an increased cytosolic calcium concentration. Here, using isothermal titration calorimetry and NMR spectroscopy, we investigated the calcium binding properties of a conserved (CaM1) and a divergent (CaM4) CaM isoform from soybean (Glycine max). Both isoforms bind calcium with a semisequential pathway that favors the calcium binding EF-hands of the C-terminal lobe over those of the N-terminal lobe. From the measured dissociation constants, CaM4 binds calcium with a threefold greater affinity than CaM1 (K(d,Ca,mean) of 5.0 versus 14.9 μM) but has a significantly reduced selectivity against the chemically similar magnesium cation that binds preferentially to EF-hand I of both isoforms. The implications of a potential magnesium/calcium competition on the activation of CaM1 and CaM4 are discussed in context with their ability to respond to stimulus-specific calcium signatures and their known physiological roles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,263
Score d'incertitude au seuil0,533

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,175 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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