Shifting fungal endophyte communities colonize<i>Bouteloua gracilis</i>: effect of host tissue and geographical distribution
Notice bibliographique
Résumé
Communities of root-associated fungi (RAF) commonly have been studied under the auspices of arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) or ectomycorrhizal fungi. However many studies now indicate that other groups of endophytic RAF, including dark septate endophytes (DSE) are more abundant in some plants and environments. The common forage grass, Bouteloua gracilis, was used as a model to examine whether RAF also colonize different organs within the same plant and to compare RAF communities from sites across North America, spanning the latitudinal range of B. gracilis (from Canada to Mexico). We compared the RAF communities of organs within individual plants at one site and within plant roots among six sites. With the possible exception of one group related to genus Paraphaeosphaeria there was little evidence that RAF colonized vertically beyond the crowns. Furthermore, although there was some variation in the constitution of rare members of the RAF communities, several taxonomically related groups dominated the RAF community at all sites. These dominant taxa included members in the Pleosporales (related to the DSE, Paraphaeosphaeria spp.), Agaricales (related to Moniliophthora spp., or Campanella spp.) and Hypocreales (related to Fusarium spp.). AMF were notable by their near absence. Similar phylotypes from the dominant groups clustered around adjacent sites so that similarity of the RAF communities was negatively correlated to site inter-distance and the RAF communities appeared to group by country. These results increase the possibility that at least some of these common and widely distributed core members of the RAF community form important, intimate and long lasting relationships with grasses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».