Phylogeny of Vitaceae based on the nuclear<i>GAI1</i>gene sequencesThis article is one of a selection of papers presented at the symposium on<i>Vitis</i>at the XVII International Botanical Congress held in Vienna, Austria, in 2005.
Notice bibliographique
Résumé
Phylogenetic analysis of 105 nuclear GAI1 sequences of Vitaceae provided a fairly robust phylogeny, largely congruent with the recently published chloroplast data of the family. In the GAI1 phylogeny, Cayratia Juss., Tetrastigma (Miq.) Planch., and Cyphostemma (Planch.) Alston form a clade. Cyphostemma and Tetrastigma are both monophyletic, and Cayratia is paraphyletic. Ampelopsis Michx is paraphyletic with the African Rhoicissus Planch. and the South American Cissus striata Ruiz & Pav. and its close relatives (e.g., Cissus simsiana Roem. & Schult.) nested within it. The pinnately leaved Ampelopsis forms a subclade, and the simple and palmately leaved Ampelopsis constitutes another subclade. All species of Cissus L. sampled from Asia, Africa, and Central and South America (except the C. striata complex) form a monophyletic group. Pterisanthes Blume of southeastern Asia forms a clade with the Asian Ampelocissus Planch. Vitis L. is monophyletic and forms a larger clade with the tropical Ampelocissus and Pterisanthes . Parthenocissus Planch., forms a clade with Yua C.L. Li, with each genus reportedly monophyletic. Cissus from the Old World is paraphyletic with the neotropical core Cissus nested within it. The basal grade of Cissus consists of taxa from Africa. The African-Asian biogeographic relationships are complex, with several intercontinental disjunctions. The Northern Hemisphere Ampelopsis is most closely related to the South American C. striata complex and the African Rhoicissus .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».