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Enregistrement W2149062454 · doi:10.2310/7070.2004.00299

Epstein-Barr Virus DNA Measured in Nasopharyngeal Brushings in Patients with Nasopharyngeal Carcinoma: Pilot Study

2004· article· en· W2149062454 sur OpenAlexaffvenue
Antti Mäkitie, Patrícia P. Reis, Tong Zhang, Soo Chin, Patrick Gullane, Lillian L. Siu, Suzanne Kamel‐Reid, Jonathan C. Irish

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Otolaryngology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHead and Neck Cancer Studies
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNasopharyngeal carcinomaMedicineReal-time polymerase chain reactionEpstein–Barr virusPolymerase chain reactionSYBR Green IVirusViral loadPathologyInternal medicineGastroenterologyVirologyGeneRadiation therapyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: We measured the amount of tumour-derived Epstein-Barr virus (EBV) deoxyribonucleic acid (DNA) in the nasal brushings of nasopharyngeal carcinoma (NPC) patients to determine the correlation with tumour load and response to treatment. MATERIALS AND METHODS: Twenty-eight patients with NPC were included in the study. Baseline measurements of EBV from nasopharyngeal brushings were obtained from 26 patients prior to treatment. A follow-up sample was available from 11 of these patients post-treatment and from 2 additional patients who did not have a baseline sample. Quantitative real-time polymerase chain reaction (PCR) using SYBR Green I fluorescent dye was used to detect the EBV DNA copy number. RESULTS: Nasopharyngeal brush biopsies showed a high copy number of EBV DNA in most of the pretreatment samples (median 9714 copies/mL). The highest copy number detected was 14536944 copies/mL in one sample. In the post-treatment follow-up samples, the copy number was significantly lower (median 6 copies/mL). CONCLUSIONS: We have demonstrated that EBV DNA can be detected in the brush biopsies from NPC patients using quantitative real-time PCR. These pilot data suggest that nasopharyngeal brushings with PCR detection of EBV may be an effective tool for determining local tumour response. The potential of this technique as an NPC tumour marker for post-treatment follow-up is being validated with larger patient numbers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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