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Enregistrement W2149117075 · doi:10.1152/ajpcell.00389.2009

Evolutionary emergence of <i>N</i>-glycosylation as a variable promoter of HCN channel surface expression

2010· article· en· W2149117075 sur OpenAlexafffund
Andrew P. Hegle, Hamed Nazzari, Andrew Roth, Damiano Angoli, Eric A. Accili

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Physiology-Cell Physiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesHeart and Stroke Foundation of British Columbia and YukonHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésGene isoformGlycosylationGatingCell biologyChemistryFunction (biology)GeneNucleotideBiochemistryBiologyBiophysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

All four mammalian hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-modulated (HCN) channel isoforms have been shown to undergo N-linked glycosylation in the brain. With the mouse HCN2 isoform as a prototype, HCN channels have further been suggested to require N-glycosylation for function, a provocative finding that would make them unique in the voltage-gated potassium channel superfamily. Here, we show that both the HCN1 and HCN2 isoforms are also predominantly N-glycosylated in the embryonic heart, where they are found in significant amounts and where HCN-mediated currents are known to regulate beating frequency. Surprisingly, we find that N-glycosylation is not required for HCN2 function, although its cell surface expression is highly dependent on the presence of N-glycans. Comparatively, disruption of N-glycosylation only modestly impacts cell surface expression of HCN1 and leaves permeation and gating functions almost unchanged. This difference between HCN1 and HCN2 is consistent with evolutionary trajectories that diverged in an isoform-specific manner after gene duplication from a common HCN ancestor that lacked N-glycosylation and was able to localize efficiently to the cell surface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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