Adaptive eukaryote‐to‐eukaryote lateral gene transfer: stress‐related genes of algal origin in the closest unicellular relatives of animals
Notice bibliographique
Résumé
In addition to mutation, gene duplication and recombination, the transfer of genetic material between unrelated species is now regarded as a potentially significant player in the shaping of extant genomes and the evolution and diversification of life. Although this is probably true for prokaryotes, the extent of such genetic exchanges in eukaryotes (especially eukaryote-to-eukaryote transfers) is more controversial and the selective advantage and evolutionary impact of such events are less documented. A laterally transferred gene could either be added to the gene complement of the recipient or replace the recipient's homologue; whereas gene replacements can be either adaptive or stochastic, gene additions are most likely adaptive. Here, we report the finding of four stress-related genes (two ascorbate peroxidase and two metacaspase genes) of algal origin in the closest unicellular relatives of animals, the choanoflagellates. At least three of these sequences represent additions to the choanoflagellate gene complement, which is consistent with these transfers being adaptive. We suggest that these laterally acquired sequences could have provided the primitive choanoflagellates with additional or more efficient means to cope with stress, especially in relation to adapting to freshwater environments and/or sessile or colonial lifestyles.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».