The role of human papillomavirus in head and neck cancer in Senegal
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Exploring the presence and role of human papillomavirus (HPV) in head and neck cancer (HNC) is a necessary step to evaluate the potential impact of HPV prophylactic vaccines. OBJECTIVE: To assess the prevalence and oncogenic role of HPV in HNC in Senegal. METHODS: This is a multicenter cross-sectional study. Paraffin-embedded blocks of cases diagnosed with invasive HNC between 2002 and 2010 were collected from 4 pathology laboratories in Senegal. Presence of HPV DNA was determined by PCR and DEIA, and genotyping performed with LiPA25. Tubulin analysis was performed to assess DNA quality. HPV DNA-positive cases were tested for p16INK4a expression. FINDINGS: A total of 117 cases were included in the analysis: 71% were men, mean age was 52 years old (SD ±18.3), and 96% of cases were squamous cell carcinoma. Analysis was performed on 41 oral cavity tumors, 64 laryngeal tumors, 5 oropharyngeal tumors and 7 pharyngeal tumors. Only four cases (3.4%; 95% CI = 0.9%-8.5%) harbored HPV DNA. HPV types detected were HPV16, HPV35 and HPV45. However, among HPV-positive cases, none showed p16INK4a overexpression. CONCLUSION: Our findings indicate that HPV DNA prevalence in HNC in Senegal is very low, suggesting that HPV is not a strong risk factor for these cancers. Additional larger studies are needed to confirm these findings and explore other potential risk factors specific to the region.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».