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Enregistrement W2149150064 · doi:10.1093/molehr/gav020

Identification of a β-galactosidase transgene that provides a live-cell marker of transcriptional activity in growing oocytes and embryos

2015· article· en· W2149150064 sur OpenAlexafffund
Nicole A. Edwards, Riaz Farookhi, Hugh J. Clarke

Notice bibliographique

RevueMolecular Human Reproduction · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMcGill University
Mots-clésBiologyTransgeneOocyteEmbryoCell biologyBlastocystTranscription factorGeneticsMolecular biologyEmbryogenesisGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Identifying the events and molecular mechanisms that regulate oocyte growth has emerged as a key objective of research in human fertility, fuelled by evidence from human and animal studies indicating that disease and environmental factors can act on oocytes to affect the health of the resulting individual and by efforts to grow oocytes in vitro to enable fertility preservation of cancer survivors. Techniques that monitor the development of growing oocytes would be valuable tools to assess the progression of growth under different conditions. Most methods used to assess oocytes grown in vitro are indirect, however, relying on characteristics of the somatic compartment of the follicle, or compromise the oocyte, preventing its subsequent culture or fertilization. We investigated the utility of T-cell factor/lymphoid enhancer-binding factor (TCF/Lef)-LacZ transgene expression as a predictor of global transcriptional activity in oocytes and early embryos. Using a fluorescent β-galactosidase substrate combined with live-cell imaging, we show that TCF/Lef-LacZ transgene expression is detectable in growing oocytes, lost in fully grown oocytes and resumes in late two-cell embryos. Transgene expression is likely regulated by a Wnt-independent mechanism. Using chromatin analysis, LacZ expression and methods to monitor and inhibit transcription, we show that TCF/Lef-LacZ expression mirrors transcriptional activity in oocytes and preimplantation embryos. Oocytes and preimplantation embryos that undergo live-cell imaging for TCF/Lef-LacZ expression are able to continue development in vitro. TCF/Lef-LacZ reporter expression in living oocytes and early embryos is thus a sensitive and faithful marker of transcriptional activity that can be used to monitor and optimize conditions for oocyte growth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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