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Enregistrement W2149204655 · doi:10.4039/tce.2014.48

Pre-release detection of a biocontrol agent: combining independent and public DNA sequences to identify the first North American record of <i>Aulacidea pilosellae</i> (Hymenoptera: Cynipidae)

2014· article· en· W2149204655 sur OpenAlexafffundabout
Chandra E. Moffat, M. Alex Smith

Notice bibliographique

RevueThe Canadian Entomologist · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueHymenoptera taxonomy and phylogeny
Établissements canadiensUniversity of GuelphUniversity of British Columbia, Okanagan CampusUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversity of Guelph
Mots-clésDNA sequencingHymenopteraDNA barcodingBiologyBiological pest controlDNASequence (biology)Evolutionary biologyGeneticsZoologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Here we report the first North American detection of the gall wasp Aulacidea pilosellae Kieffer (Hymenoptera: Cynipidae), native to Central Europe and a promising candidate biological control agent for invasive hawkweeds ( Pilosella Vaillant, Asteraceae) in North America. This occurrence was discovered through the intersection of (i) publically available DNA barcode data and (ii) DNA sequencing of a biocontrol agent before its release. COI DNA sequences of A. pilosellae collected in Central Europe were compared with publically available DNA sequence records. Despite the presence of other Aulacidea Ashmead in the database, the most similar sequence to the European A. pilosellae was an as yet unidentified specimen collected in the Ottawa Valley of eastern Ontario, Canada. Subsequent sequencing of a second gene region (28S-D2) of the Ottawa Valley specimen yielded an identical DNA sequence to the European A. pilosellae , confirming the presence of this species in Ontario. This note highlights the potential synergy that can result from making DNA barcode data publically available before formal taxonomic identification, and a new benefit of incorporating DNA sequencing of standardised markers into biological control programmes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,553
Score d'incertitude au seuil0,597

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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