MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2149241440 · doi:10.1111/j.1365-313x.2009.03815.x

The targeting of the oxysterol‐binding protein ORP3a to the endoplasmic reticulum relies on the plant VAP33 homolog PVA12

2009· article· en· W2149241440 sur OpenAlexaff
Ramu S. Saravanan, Erin Slabaugh, Vijay Raj Singh, Lisa J. Lapidus, Thomas A. Haas, Federica Brandizzí

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesOffice of ScienceBurroughs Wellcome Fund
Mots-clésEndoplasmic reticulumGolgi apparatusOxysterolBiologyCell biologyArabidopsisSterolBiochemistrySecretory pathwayGeneMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In plants, sterols play fundamental roles as membrane constituents in the biosynthesis of steroid hormones, and act as precursors for cell wall deposition. Sterols are synthesized in the endoplasmic reticulum (ER), but mainly accumulate in the plasma membrane. How sterols are trafficked in plant cells is largely unknown. In non-plant systems, oxysterol-binding proteins have been involved in sterol trafficking and homeostasis. There are at least twelve homologs of oxysterol-binding proteins in the Arabidopsis genome, but the biology of these proteins remains for the most part obscure. Here, we report our analysis of the targeting requirements and the sterol-binding properties of a small Arabidopsis oxysterol-binding protein, ORP3a. We have determined that ORP3a is a bona fide sterol-binding protein with sitosterol-binding properties. Live-cell imaging analyses revealed that ORP3a is localized at the ER, and that binding to this organelle depends on a direct interaction with PVA12, a member of the largely uncharacterized VAP33 family of plant proteins. Molecular modeling analyses and site-directed mutagenesis led to the identification of a novel protein domain that is responsible for the PVA12-ORP3a interaction. Disruption of the integrity of this domain caused redistribution of ORP3a to the Golgi apparatus, suggesting that ORP3a may cycle between the ER and the Golgi. These results represent new insights into the biology of sterol-binding proteins in plant cells, and elucidate a hitherto unknown relationship between members of oxysterol-binding protein and VAP33 families of plant proteins in the early plant secretory pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,427
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations79
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Plant JournalMême sujetCholesterol and Lipid MetabolismTravaux en français237 207