Characterization and Synergistic Interactions of <i>Fibrobacter succinogenes</i> Glycoside Hydrolases
Notice bibliographique
Résumé
The objectives of this study were to characterize Fibrobacter succinogenes glycoside hydrolases from different glycoside hydrolase families and to study their synergistic interactions. The gene encoding a major endoglucanase (endoglucanase 1) of F. succinogenes S85 was identified as cel9B from the genome sequence by reference to internal amino acid sequences of the purified native enzyme. Cel9B and two other glucanases from different families, Cel5H and Cel8B, were cloned and overexpressed, and the proteins were purified and characterized. These proteins in conjunction with two predominant cellulases, Cel10A, a chloride-stimulated cellobiosidase, and Cel51A, formerly known as endoglucanase 2 (or CelF), were assayed in various combinations to assess their synergistic interactions using ball-milled cellulose. The degree of synergism ranged from 0.6 to 3.7. The two predominant endoglucanases produced by F. succinogenes, Cel9B and Cel51A, were shown to have a synergistic effect of up to 1.67. Cel10A showed little synergy in combination with Cel9B and Cel51A. Mixtures containing all the enzymes gave a higher degree of synergism than those containing two or three enzymes, which reflected the complementarity in their modes of action as well as substrate specificities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».