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A Bayesian Networks Approach for Predicting Protein-Protein Interactions from Genomic Data

2003· article· en· 1 279 citations· W2149310258 sur OpenAlex· 10.1126/science.1087361

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants
0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

We have developed an approach using Bayesian networks to predict protein-protein interactions genome-wide in yeast. Our method naturally weights and combines into reliable predictions genomic features only weakly associated with interaction (e.g., messenger RNAcoexpression, coessentiality, and colocalization). In addition to de novo predictions, it can integrate often noisy, experimental interaction data sets. We observe that at given levels of sensitivity, our predictions are more accurate than the existing high-throughput experimental data sets. We validate our predictions with TAP (tandem affinity purification) tagging experiments. Our analysis, which gives a comprehensive view of yeast interactions, is available at genecensus.org/intint.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Science
Thématique
Bioinformatics and Genomic Networks
Domaine
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens
University of Toronto
Organismes subventionnaires
Mots-clés
Bayesian probabilityComputational biologyComputer scienceSensitivity (control systems)GenomeProtein–protein interactionInteraction networkColocalizationData miningMachine learningArtificial intelligenceBiologyGeneticsGene
Résumé présent dans OpenAlex
oui