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Enregistrement W2149479109 · doi:10.1093/aob/mcm205

Inferring the Geometry of Fourth-Period Metallic Elements in Arabidopsis thaliana Seeds using Synchrotron-Based Multi-Angle X-ray Fluorescence Mapping

2007· article· en· W2149479109 sur OpenAlexaff
Lester Young, Neil D. Westcott, Colleen Christensen, Jeff Terry, Derek J. Lydiate, Martin J. T. Reaney

Notice bibliographique

RevueAnnals of Botany · 2007
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueX-ray Spectroscopy and Fluorescence Analysis
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanCanadian Light Source (Canada)Agriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesArgonne National Laboratory
Mots-clésX-ray fluorescenceBiologyDistribution (mathematics)SynchrotronMetalFluorescenceSynchrotron radiationConstraint (computer-aided design)Biological systemGeometryMaterials sciencePhysicsOpticsMathematicsMathematical analysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Improving our knowledge of plant metal metabolism is facilitated by the use of analytical techniques to map the distribution of elements in tissues. One such technique is X-ray fluorescence (XRF), which has been used previously to map metal distribution in both two and three dimensions. One of the difficulties of mapping metal distribution in two dimensions is that it can be difficult to normalize for tissue thickness. When mapping metal distribution in three dimensions, the time required to collect the data can become a major constraint. In this article a compromise is suggested between two- and three-dimensional mapping using multi-angle XRF imaging. METHODS: A synchrotron-based XRF microprobe was used to map the distribution of K, Ca, Mn, Fe, Ni, Cu and Zn in whole Arabidopsis thaliana seeds. Relative concentrations of each element were determined by measuring fluorescence emitted from a 10 microm excitation beam at 13 keV. XRF spectra were collected from an array of points with 25 or 30 microm steps. Maps were recorded at 0 and 90 degrees , or at 0, 60 and 120 degrees for each seed. Using these data, circular or ellipsoidal cross-sections were modelled, and from these an apparent pathlength for the excitation beam was calculated to normalize the data. Elemental distribution was mapped in seeds from ecotype Columbia-4 plants, as well as the metal accumulation mutants manganese accumulator 1 (man1) and nicotianamine synthetase (nasx). CONCLUSIONS: Multi-angle XRF imaging will be useful for mapping elemental distribution in plant tissues. It offers a compromise between two- and three-dimensional XRF mapping, as far as collection times, image resolution and ease of visualization. It is also complementary to other metal-mapping techniques. Mn, Fe and Cu had tissue-specific accumulation patterns. Metal accumulation patterns were different between seeds of the Col-4, man1 and nasx genotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,220
Score d'incertitude au seuil0,878

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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