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Enregistrement W2149627803 · doi:10.1099/jmm.0.47783-0

Analysis of Helicobacter pylori isolates from Chile: occurrence of selective type 1 Lewis b antigen expression in lipopolysaccharide

2008· article· en· W2149627803 sur OpenAlexaff
Eleonora Altman, Heriberto Fernández, Vandana Chandan, Blair A. Harrison, Myra Wilson Schuster, Laura Otth Rademacher, Claudio Toledo

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Microbiology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHelicobacter pylori-related gastroenterology studies
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesPan American Health Organization
Mots-clésCagAHelicobacter pyloriPolyclonal antibodiesEpitopeAntigenBiologyMicrobiologyMonoclonal antibodyLipopolysaccharideBlotMolecular biologyAntibodyWestern blotVirologyGeneVirulenceImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies have shown that the LPS of Helicobacter pylori isolated from North American and European hosts predominantly expresses type 2 Lewis x (Le(x)) and Le(y) epitopes, whilst the LPS from Asian strains has the capacity to express type 1 Le(a) and Le(b) structures. The aim of this study was to evaluate the expression of Le antigens and the cytotoxin-associated antigen (CagA) by H. pylori isolates from Chile. A total of 38 isolates were screened. The expression of Le antigens and CagA was determined by whole-cell indirect ELISA, using commercially available monoclonal anti-Le and polyclonal anti-CagA antibodies. LPS profiles of H. pylori isolates were assessed by gel electrophoresis and Western blotting. Expression of Le(x) and/or Le(y) epitopes was confirmed in 32/38 isolates (84 %), whilst 9/38 isolates (24 %) expressed type 1 Le(b) blood group determinants, in addition to type 2 Le(x) and Le(y) structures. Six strains (16 %) were non-typeable. The majority of H. pylori strains examined were CagA-positive (83.3 %).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,268
Score d'incertitude au seuil0,598

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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