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Enregistrement W2149656912 · doi:10.1096/fj.09-134981

Heparan sulfate promotes the aggregation of HDL‐associated serum amyloid A: evidence for a proamyloidogenic histidine molecular switch

2009· article· en· W2149656912 sur OpenAlexafffund
Elena Elimova, Robert Kisilevsky, John B. Ancsin

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensKingston General HospitalQueen's UniversityUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSerum amyloid AHeparan sulfateChemistryHistidineAmyloid (mycology)BiochemistryApolipoprotein BAmyloidosisPlasma protein bindingPeptideBinding siteReceptorGlycosaminoglycanAmino acidBiologyInternal medicineImmunologyCholesterolInflammation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During inflammatory diseases, serum amyloid A (SAA), an acute-phase apolipoprotein of HDL, can assemble into tissue deposits called AA amyloids. The mechanism and physiological factors promoting amyloidosis are largely unknown but likely involve heparan sulfate (HS), a glycosaminoglycan colocalized with all types of amyloids. In this study, we explored HDL-SAA:HS interactions using in vitro and cell culture assays to identify HS-binding domains that promote the conversion of native SAA into AA amyloid. HS causes the remodeling of HDL-SAA at mildly acidic pH, producing SAA-rich aggregates. A sequence motif in SAA responsible for this conversion was identified that contains a pH-sensitive heparin/HS-binding site, functions as a ligand for a cell surface receptor, and acts as a structural focal point for SAA aggregation. Synthetic peptides corresponding to this region promoted the deposition of AA amyloid in a monocyte culture model for AA amyloidogenesis. The effects were peptide sequence specific and reliant on the protonation of H36. We conclude that a highly conserved motif required for SAA binding to macrophages can, under acidic pH conditions and in an HS-dependent manner, also act as a molecular switch, directing SAA misfolding into AA amyloid. Similar histidine-dependent HS-binding sites are also found in other amyloidogenic polypeptides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,432

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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