The Yeast Model for Batten Disease: Mutations in <i>btn1</i> , <i>btn2</i> , and <i>hsp30</i> Alter pH Homeostasis
Notice bibliographique
Résumé
The BTN1 gene product of the yeast Saccharomyces cerevisiae is 39% identical and 59% similar to human CLN3, which is associated with the neurodegenerative disorder Batten disease. Furthermore, btn1-Delta strains have an elevated activity of the plasma membrane H(+)-ATPase due to an abnormally high vacuolar acidity during the early phase of growth. Previously, DNA microarray analysis revealed that btn1-Delta strains compensate for the altered plasma membrane H(+)-ATPase activity and vacuolar pH by elevating the expression of the two genes HSP30 and BTN2. We now show that deletion of either HSP30 or BTN2 in either BTN1(+) or btn1-Delta strains does not alter vacuolar pH but does lead to an increased activity of the vacuolar H(+)-ATPase. Deletion of BTN1, BTN2, or HSP30 does not alter cytosolic pH but diminishes pH buffering capacity and causes poor growth at low pH in a medium containing sorbic acid, a condition known to result in disturbed intracellular pH homeostasis. Btn2p was localized to the cytosol, suggesting a role in mediating pH homeostasis between the vacuole and plasma membrane H(+)-ATPase. Increased expression of HSP30 and BTN2 in btn1-Delta strains and diminished growth of btn1-Delta, hsp30-Delta, and btn2-Delta strains at low pH reinforce our view that altered pH homeostasis is the underlying cause of Batten disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».