Polymorphic variants in PTGS2 and prostate cancer risk: results from two large nested case-control studies
Notice bibliographique
Résumé
Chronic inflammation has been hypothesized to increase prostate cancer risk. Prostaglandin-endoperoxide synthase 2 (PTGS2) encodes the proinflammatory cyclooxygenase 2 enzyme believed to be the rate-limiting step in the synthesis of prostaglandins, important mediators of inflammation. We investigated associations between PTGS2 polymorphisms and prostate cancer risk among 2321 prostate cancer cases and 2560 controls in two large case-control studies nested within the Prostate, Lung, Colorectal and Ovarian (PLCO) Cancer Screening Trial and the Cancer Prevention Study II Nutrition Cohort. Five single nucleotide polymorphisms (SNPs) (rs5277, rs20432, rs4648276, rs5275 and rs689470) were examined in SNP and haplotype analyses (five SNPs in PLCO and four SNPs in the Nutrition Cohort). In PLCO, the Ex10 +837 T>C marker (rs5275) was initially associated with prostate cancer risk (P-trend = 0.02) but became non-significant after adjustment for multiple comparisons (P = 0.08); this SNP showed no association with prostate cancer risk in the Nutrition Cohort (P-trend = 0.54) or in an analysis pooling the two cohorts (P-trend = 0.20). No other SNP was associated with prostate cancer risk in PLCO or the Nutrition Cohort individually or combined. Haplotype analyses suggested an association between PTGS2 variants in PLCO alone (global P = 0.007), but not in the Nutrition Cohort (global P = 0.78) or pooled analysis (global P = 0.18). In conclusion, despite the potential importance of inflammation in prostate carcinogenesis, results from our large study of five PTGS2 SNPs does not support a strong association between PTGS2 variants and prostate cancer risk in non-Hispanic white men.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».