α‐ and β‐Tubulin Phylogenies Support a Close Relationship Between the Microsporidia <i>Brachiola algerae</i> and <i>Antonospora locustae</i>
Notice bibliographique
Résumé
Microsporidia are a large and diverse group of intracellular parasites related to fungi. Much of our understanding of the relationships between microsporidia comes from phylogenies based on a single gene, the small subunit (SSU) rRNA, because only this gene has been sampled from diverse microsporidia. However, SSUrRNA trees are limited in their ability to resolve basal branches and some microsporidian affiliations are inconsistent between different analyses. Protein phylogenies have provided insight into relationships within specific groups of microsporidia, but have rarely been applied to the group as a whole. We have sequenced alpha- and beta-tubulins from microsporidia from three different subgroups, including representatives from what have previously been inferred to be the basal branches, allowing the broadest sampled protein-based phylogenetic analysis to date. Although some relationships remain unresolved, many nodes uniting subgroups are strongly supported and consistent in both individual trees as well as a concatenate of both tubulins. One such relationship that was previously unclear is between Brachiola algerae and Antonospora locustae, and their close association with Encephalitozoon and Nosema. Also, an uncultivated microsporidian that infects cyclopoid copepods is shown to be related to Edhazardia aedis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».