Increasing the relative expression of endogenous non-coding Steroid Receptor RNA Activator (SRA) in human breast cancer cells using modified oligonucleotides
Notice bibliographique
Résumé
Products of the Steroid Receptor RNA Activator gene (SRA1) have the unusual property to modulate the activity of steroid receptors and other transcription factors both at the RNA (SRA) and the protein (SRAP) level. Balance between these two genetically linked entities is controlled by alternative splicing of intron-1, whose retention alters SRAP reading frame. We have previously found that both fully-spliced SRAP-coding and intron-1-containing non-coding SRA RNAs co-exist in breast cancer cell lines. Herein, we report a significant (Student's t-test, P < 0.003) higher SRA-intron-1 relative expression in breast tumors with higher progesterone receptor contents. Using an antisense oligoribonucleotide, we have successfully reprogrammed endogenous SRA splicing and increased SRA RNA-intron-1 relative level in T5 breast cancer cells. This increase is paralleled by significant changes in the expression of genes such as plasminogen urokinase activator and estrogen receptor beta. Estrogen regulation of other genes, including the anti-metastatic NME1 gene, is also altered. Overall, our results suggest that the balance coding/non-coding SRA transcripts not only characterizes particular tumor phenotypes but might also, through regulating the expression of specific genes, be involved in breast tumorigenesis and tumor progression.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».