Enzymatic activity of Campylobacter jejuni hippurate hydrolase
Notice bibliographique
Résumé
The hippurate hydrolase enzyme of Campylobacter jejuni was expressed in Escherichia coli as a six-histidine-tagged fusion protein. The purified recombinant enzyme was characterized to gain an understanding of the structure and activity of the hippurate hydrolase. The recombinant enzyme had a native molecular mass of 193+/- 11 kDa a reduced molecular mass of 42.4+/- 0.8 kDa, and possessed 1.98+/- 0.68 molecules of zinc per enzyme subunit molecule, suggesting that it was a homotetramer with two associated zinc ions. The enzyme was a metallocarboxypeptidase that was sensitive to silver, copper and ferrous ions, and displayed optimal activity at pH 7.5 and 50 degrees C. It hydrolyzed carboxypeptidase substrates in vitro, displaying its highest activity against N-benzoyl-linked small aliphatic amino acids. A high proportion of the enzyme structure consisted of highly ordered alpha-helix and beta-sheet sequences. An alignment of the amino acid sequence of the hippurate hydrolase enzyme with those of related enzymes with similar activities revealed several conserved amino acids, which might be involved in enzyme catalysis or metal ion binding for the enzyme. Site-directed mutagenesis of the recombinant enzyme demonstrated that the Asp(76), Aps(104), Glu(134), Glu(135), His(161) and His(356) positions were important for the catalytic activity of the enzyme.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».