2011 CCNP Heinz Lehman Award paper: Searching for an endogenous anti-Alzheimer molecule: identifying small molecules in the brain that slow Alzheimer disease progression by inhibition of β-amyloid aggregation
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Alzheimer disease is a neurodegenerative disorder that progresses with marked interindividual clinical variability. We postulate the existence of endogenous molecules within the human brain exerting an antiaggregant activity that will prevent/slow Alzheimer disease progression. METHODS: We performed in silico studies to determine if the small endogenous molecules L-phosphoserine (L-PS) and 3-hydroxyanthranilic acid (3-HAA) could bind to the target region of ß-amyloid responsible for protein misfolding. In vitro assays measured the antiaggregation effect of these molecules at varying concentrations. RESULTS: In silico studies demonstrated that L-PS and 3-HAA, both endogenous brain molecules, were capable of binding to the histidine(13)-histidine-glutamine-lysine(16) (HHQK) region of ß-amyloid involved in misfolding: these interactions were energetically favoured. The in vitro assays showed that both L-PS and 3-HAA were capable of inhibiting ß-amyloid aggregation in a dose-dependent manner, with 3-HAA being more potent than L-PS. LIMITATIONS: Studies were performed in silico and in vitro but not in vivo. CONCLUSION: We successfully identified 2 endogenous brain molecules, L-PS and 3-HAA, that were capable of binding to the region of ß-amyloid that leads to protein misfolding and neurotoxicity. Both L-PS and 3-HAA were able to inhibit ß-amyloid aggregation in varying concentrations; levels of these compounds in the brain may impact their effectiveness in slowing/preventing ß-amyloid aggregation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,250 | 0,091 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».