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Enregistrement W2150023995 · doi:10.1503/jpn.120166

2011 CCNP Heinz Lehman Award paper: Searching for an endogenous anti-Alzheimer molecule: identifying small molecules in the brain that slow Alzheimer disease progression by inhibition of β-amyloid aggregation

2013· article· en· W2150023995 sur OpenAlexaffvenue
Autumn Meek, Gordon A. Simms, Donald F. Weaver

Notice bibliographique

RevueJournal of Psychiatry and Neuroscience · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAmyloid (mycology)EndogenyNeurotoxicityChemistryIn silicoBiochemistryIn vitroIn vivoAlzheimer's diseaseHuman brainSmall moleculePharmacologyBiologyNeuroscienceInternal medicineMedicineToxicityDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Alzheimer disease is a neurodegenerative disorder that progresses with marked interindividual clinical variability. We postulate the existence of endogenous molecules within the human brain exerting an antiaggregant activity that will prevent/slow Alzheimer disease progression. METHODS: We performed in silico studies to determine if the small endogenous molecules L-phosphoserine (L-PS) and 3-hydroxyanthranilic acid (3-HAA) could bind to the target region of ß-amyloid responsible for protein misfolding. In vitro assays measured the antiaggregation effect of these molecules at varying concentrations. RESULTS: In silico studies demonstrated that L-PS and 3-HAA, both endogenous brain molecules, were capable of binding to the histidine(13)-histidine-glutamine-lysine(16) (HHQK) region of ß-amyloid involved in misfolding: these interactions were energetically favoured. The in vitro assays showed that both L-PS and 3-HAA were capable of inhibiting ß-amyloid aggregation in a dose-dependent manner, with 3-HAA being more potent than L-PS. LIMITATIONS: Studies were performed in silico and in vitro but not in vivo. CONCLUSION: We successfully identified 2 endogenous brain molecules, L-PS and 3-HAA, that were capable of binding to the region of ß-amyloid that leads to protein misfolding and neurotoxicity. Both L-PS and 3-HAA were able to inhibit ß-amyloid aggregation in varying concentrations; levels of these compounds in the brain may impact their effectiveness in slowing/preventing ß-amyloid aggregation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,250
Score d'incertitude au seuil0,836

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0040,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,2500,091

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,072
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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