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Enregistrement W2150031347 · doi:10.1056/nejmoa072200

Gene Identification for the cblD Defect of Vitamin B<sub>12</sub>Metabolism

2008· article· en· W2150031347 sur OpenAlexaff
David Coelho, Terttu Suormala, Martin Stucki, Jordan Lerner‐Ellis, David S. Rosenblatt, Robert F. Newbold, Matthias R. Baumgartner, Brian Fowler

Notice bibliographique

RevueNew England Journal of Medicine · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCobalaminMethylmalonic aciduriaAdenosylcobalaminHomocystinuriaBiologyMethylcobalaminMethylmalonic acidComplementationMutantMolecular biologyGeneticsBiochemistryHomocysteineGeneVitamin B12MethionineAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Vitamin B12 (cobalamin) is an essential cofactor in several metabolic pathways. Intracellular conversion of cobalamin to its two coenzymes, adenosylcobalamin in mitochondria and methylcobalamin in the cytoplasm, is necessary for the homeostasis of methylmalonic acid and homocysteine. Nine defects of intracellular cobalamin metabolism have been defined by means of somatic complementation analysis. One of these defects, the cblD defect, can cause isolated methylmalonic aciduria, isolated homocystinuria, or both. Affected persons present with multisystem clinical abnormalities, including developmental, hematologic, neurologic, and metabolic findings. The gene responsible for the cblD defect has not been identified. METHODS: We studied seven patients with the cblD defect, and skin fibroblasts from each were investigated in cell culture. Microcell-mediated chromosome transfer and refined genetic mapping were used to localize the responsible gene. This gene was transfected into cblD fibroblasts to test for the rescue of adenosylcobalamin and methylcobalamin synthesis. RESULTS: The cblD gene was localized to human chromosome 2q23.2, and a candidate gene, designated MMADHC (methylmalonic aciduria, cblD type, and homocystinuria), was identified in this region. Transfection of wild-type MMADHC rescued the cellular phenotype, and the functional importance of mutant alleles was shown by means of transfection with mutant constructs. The predicted MMADHC protein has sequence homology with a bacterial ATP-binding cassette transporter and contains a putative cobalamin binding motif and a putative mitochondrial targeting sequence. CONCLUSIONS: Mutations in a gene we designated MMADHC are responsible for the cblD defect in vitamin B12 metabolism. Various mutations are associated with each of the three biochemical phenotypes of the disorder.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations169
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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