<i>CTLA4</i>gene polymorphisms are associated with chronic bronchitis
Notice bibliographique
Résumé
Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is characterised by chronic and progressive dyspnoea, cough and sputum production. T-lymphocytes may play a key role in the pathogenesis of COPD and chronic bronchitis. Cytotoxic T-lymphocyte antigen (CTLA) 4 is a potential candidate gene because it modulates T-cell activation. Genetic association between nine CTLA4 single nucleotide polymorphisms (SNPs) and chronic bronchitis was assessed in 606 pedigrees (1,896 individuals) from the International COPD Genetics Network (ICGN) population. We then replicated the associations in 342 COPD subjects with chronic bronchitis and 511 COPD subjects without chronic bronchitis from Bergen, Norway. Family-based association tests were used to analyse the ICGN cohort, and a logistic regression model was used for the Bergen cohort. Six CTLA4 SNPs were significantly associated with chronic bronchitis in the ICGN cohort (0.0079< or = p < or =0.0432), with three being replicated with the same directionality of association in the Bergen cohort (0.0325< or = p < or =0.0408). One of these replicated SNPs (rs231775) encodes the Thr to Ala substitution at amino acid position 17. Haplotype analyses supported the results of single SNP analyses. Thus, CTLA4 is likely to be a genetic determinant of chronic bronchitis among COPD cases.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».