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Enregistrement W2150071247 · doi:10.1128/jcm.01305-07

Yield of Stool Culture with Isolate Toxin Testing versus a Two-Step Algorithm Including Stool Toxin Testing for Detection of Toxigenic <i>Clostridium difficile</i>

2007· article· en· W2150071247 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Microbiology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCenters for Disease Control and PreventionConsortium canadien en neurodégénérescence associée au vieillissementJohns Hopkins University
Mots-clésClostridium difficileClostridium difficile toxin AToxinMicrobiologyClostridium difficile toxin BGlutamate dehydrogenaseGold standard (test)BiologyMedicineAntibioticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We examined the incremental yield of stool culture (with toxin testing on isolates) versus our two-step algorithm for optimal detection of toxigenic Clostridium difficile. Per the two-step algorithm, stools were screened for C. difficile-associated glutamate dehydrogenase (GDH) antigen and, if positive, tested for toxin by a direct (stool) cell culture cytotoxicity neutralization assay (CCNA). In parallel, stools were cultured for C. difficile and tested for toxin by both indirect (isolate) CCNA and conventional PCR if the direct CCNA was negative. The "gold standard" for toxigenic C. difficile was detection of C. difficile by the GDH screen or by culture and toxin production by direct or indirect CCNA. We tested 439 specimens from 439 patients. GDH screening detected all culture-positive specimens. The sensitivity of the two-step algorithm was 77% (95% confidence interval [CI], 70 to 84%), and that of culture was 87% (95% CI, 80 to 92%). PCR results correlated completely with those of CCNA testing on isolates (29/29 positive and 32/32 negative, respectively). We conclude that GDH is an excellent screening test and that culture with isolate CCNA testing detects an additional 23% of toxigenic C. difficile missed by direct CCNA. Since culture is tedious and also detects nontoxigenic C. difficile, we conclude that culture is most useful (i) when the direct CCNA is negative but a high clinical suspicion of toxigenic C. difficile remains, (ii) in the evaluation of new diagnostic tests for toxigenic C. difficile (where the best reference standard is essential), and (iii) in epidemiologic studies (where the availability of an isolate allows for strain typing and antimicrobial susceptibility testing).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,013
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,081
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,013
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle