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Correction: Choroid Sprouting Assay: An Ex Vivo Model of Microvascular Angiogenesis

2013· article· en· W2150116013 sur OpenAlexafffund
Zhuo Shao, M. Friedländer, Christian G. Hurst, Zhenghao Cui, Dorothy T. Pei, Lucy Evans, Aimee M. Juan, Houda Tahiri, François Duhamel, Jing Chen, Przemysław Sapieha, Sylvain Chemtob, Jean-Sébastien Joyal, Lois E. H. Smith

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAngiogenesis and VEGF in Cancer
Établissements canadiensUniversité de MontréalHôpital Maisonneuve-RosemontCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesAlcon Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchBrightFocus FoundationCharles H. Hood FoundationNational Institutes of HealthV. Kann Rasmussen FoundationResearch to Prevent Blindness
Mots-clésEx vivoSprouting angiogenesisAngiogenesisNeovascularizationIn vivoMedicineBiologyCancer researchBiotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Angiogenesis of the microvasculature is central to the etiology of many diseases including proliferative retinopathy, agerelated macular degeneration and cancer.A mouse model of microvascular angiogenesis would be very valuable and enable access to a wide range of genetically manipulated tissues that closely approximate small blood vessel growth in vivo.Vascular endothelial cells cultured in vitro are widely used, however, isolating pure vascular murine endothelial cells is technically challenging.A microvascular mouse explant model that is robust, quantitative and can be reproduced without difficulty would overcome these limitations.Here we characterized and optimized for reproducibility an organotypic microvascular angiogenesis mouse and rat model from the choroid, a microvascular bed in the posterior of eye.The choroidal tissues from C57BL/6J and 129S6/SvEvTac mice and Sprague Dawley rats were isolated and incubated in Matrigel.Vascular sprouting was comparable between choroid samples obtained from different animals of the same genetic background.The sprouting area, normalized to controls, was highly reproducible between independent experiments.We developed a semi-automated macro in ImageJ software to allow for more efficient quantification of sprouting area.Isolated choroid explants responded to manipulation of the external environment while maintaining the local interactions of endothelial cells with neighboring cells, including pericytes and macrophages as evidenced by immunohistochemistry and fluorescence-activated cell sorting (FACS) analysis.This reproducible ex vivo angiogenesis assay can be used to evaluate angiogenic potential of pharmacologic compounds on microvessels and can take advantage of genetically manipulated mouse tissue for microvascular disease research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,062
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil0,256

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,062
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,003
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,002
Intégrité de la recherche0,0040,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0760,026

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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