Major histocompatibility complex heterozygote advantage and widespread bacterial infections in populations of Chinook salmon (<i>Oncorhynchus tshawytscha</i>)
Notice bibliographique
Résumé
Despite growing evidence for parasite-mediated selection on the vertebrate major histocompatibility complex (MHC), little is known about variation in the bacterial parasite community within and among host populations or its influence on MHC evolution. In this study, we characterize variation in the parasitic bacterial community associated with Chinook salmon (Oncorhynchus tshawytscha) fry in five populations in British Columbia (BC), Canada across 2 years, and examine whether bacterial infections are a potential source of selection on the MHC. We found an unprecedented diversity of bacteria infecting fry with a total of 55 unique bacteria identified. Bacterial infection rates varied from 9% to 29% among populations and there was a significant isolation by distance relationship in bacterial community phylogenetic similarity across the populations. Spatial variation in the frequency of infections and in the phylogenetic similarity of bacterial communities may result in differential parasite-mediated selection at the MHC across populations. Across all populations, we found evidence of a heterozygote advantage at the MHC class II, which may be a source of balancing selection on this locus. Interestingly, a co-inertia analysis indicated only susceptibility associations between a few of the MHC class I and II alleles and specific bacterial parasites; there was no evidence that any of the alleles provided resistance to the bacteria. Our results reveal a complex bacterial community infecting populations of a fish and underscore the importance of considering the role of multiple pathogens in the evolution of host adaptations.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».