A new rapid and micro‐scale hydrolysis, using triethylamine citrate, for lipopolysaccharide characterization by mass spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
Endotoxin (lipopolysaccharide, LPS) is, in general, composed of two moieties: a hydrophilic polysaccharide linked to a hydrophobic lipid A terminal unit and forms a major surface component of gram-negative bacteria. The structural features of LPS moieties play a role in pathogenesis and also involve immunogenicity and diagnostic serology. The major toxic factor of LPS resides in the lipid A moiety, anchored in the outer layer of the bacterium, and its relative biological activity is critically related to fine structural features within the molecule. In establishing relationships between structural features and biological activities of LPS it is of the utmost importance to develop new analytical methods that can be applied to the complete unambiguous characterization of a specific LPS molecule. Herein is presented a practical rapid and sensitive analytical procedure for the mass spectral screening of LPS using triethylamine citrate as an agent for both disaggregation and mild hydrolysis of LPS. It provides improved matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) mass spectra and, in particular, affords the identification of fragments retaining labile substituents present in the native macromolecular LPS structures. The methods were developed and applied using purified LPS of Escherichia coli and Salmonella enterica, as well as more complex LPS of Actnobacillus pleuropneumoniae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».