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Enregistrement W2150211930 · doi:10.1111/j.1399-0004.2010.01609.x

Personalized medicine - the promised land: are we there yet?

2010· review· en· W2150211930 sur OpenAlexaff
Chang-Ming Li

Notice bibliographique

RevueClinical Genetics · 2010
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensMcMaster University Medical Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPersonalized medicinePrecision medicineGeneticistHuman genomeGeneticsGenomePersonal genomicsGenetic testingGenomicsGenome-wide association studyPenetranceHuman geneticsComputational biologyBiologyMedicineBioinformaticsSingle-nucleotide polymorphismGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Li C. Personalized medicine – the promised land: are we there yet? The delivery of personalized genomic medicine (refer Table 1 for a comparison of genomic vs genetic medicine and box 1 for glossary) hinges on obtaining personal genomic data through genome-wide association studies (GWAS) or whole-genome sequencing. After the completion of the human genome project (see box 2 for human genome projects and its derivative projects) in 2003, there appeared to be a period of euphoric optimism that as soon as the cost of sequencing the whole human genome could be brought down to an affordable range, the promise of personalized medicine would become a reality. However, inasmuch as the miraculous technological advancements are making whole-genome data acquisition an inexpensive reality, we are also starting to appreciate that making sense of the enormous amount of genomic data is a far bigger hurdle. Issues, both scientific and ethico-legal, will have to be addressed as genomic data are been pushed for clinical and direct-to-consumer utilization. Table 1. A simplified comparison of clinical genetics and the anticipated genomic medicine Clinical genetics Genomic medicine Emphasis Rare or very rare diseases Common complex diseases Genes involved Monogenic or oligogenic Often unknown Genomic changes Chromosome rearrangements, aneuploidy, copy number variants, deletions, duplications Multiple variants/polymorphisms Penetrance High Low Disease detection Diagnostic, carrier testing and pre-symptomatic testing Predictive risk assessment Pre-symptomatic testing High predictive value Low predictive value (not yet proven) Treatment Variable approaches Personalized approach based on genome info Clinical geneticist Medical doctors, well educated and trained in this specialty Minimal education and training Laboratory geneticist Usually PhDs, well educated and trained overseeing clinical service laboratories Usually PhD researchers without direct clinical involvement

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,974
Score d'incertitude au seuil0,991

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,119
Tête enseignante GPT0,425
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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