Siblings With Ischemic Stroke Study
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND AND PURPOSE: Ischemic stroke has a strong familial component to risk. The Siblings With Ischemic Stroke Study (SWISS) is a genome-wide, family-based analysis that included use of imputed genotypes. The Siblings With Ischemic Stroke Study was conducted to examine the associations between single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and risk of stroke and stroke subtypes within pairs. METHODS: The Siblings With Ischemic Stroke Study enrolled 312 probands with ischemic stroke from 70 US and Canadian centers. Affected siblings were ascertained by centers and confirmed by central record review; unaffected siblings were ascertained by telephone contact. Ischemic stroke was subtyped according to Trial of Org 10172 in Acute Stroke Treatment criteria. Genotyping was performed with an Illumina 610 quad array (probands) and an Illumina linkage V array (affected siblings). SNPs were imputed by using 1000 Genomes Project data and MACH software. Family-based association analyses were conducted by using the sibling transmission-disequilibrium test. RESULTS: For all pairs, the correlation of age at stroke within pairs of affected siblings was r=0.83 (95% CI, 0.78-0.86; P<2.2×10(-16)). The correlation did not differ substantially by subtype. The concordance of stroke subtypes among affected pairs was 33.8% (kappa=0.13; P=5.06×10(-4)) and did not differ by age at stroke in the proband. Although no SNP achieved genome-wide significance for risk of ischemic stroke, there was clustering of the most associated SNPs on chromosomes 3p (neuronal nitric oxide synthase) and 6p. CONCLUSIONS: Stroke subtype and age at stroke in affected sibling pairs exhibit significant clustering. No individual SNP reached genome-wide significance. However, 2 promising candidate loci were identified, including 1 that contains neuronal nitric oxide synthase, although these risk loci warrant further examination in larger sample collections.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,010 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».