Genetic Heterogeneity of 8q24 Region in Susceptibility to Cancer
Notice bibliographique
Résumé
A region of chromosome 8q24 contains a cluster of single nucleotide polymorphism (SNP) markers that are differentially associated with cancers at a number of different sites. Various SNPs in 8q24.21 region have been reported to be associated with breast, colorectal, and prostate cancers in several studies and in many ethnic groups ( 1–3 ). Most variants were associated with a cancer at a single site; however, one SNP (rs6983267) was associated with both prostate and colon cancers ( 4 ). It is of interest to determine how many distinct susceptibility loci are present in the region, which cancer sites are associated with each locus (and to what degree), and if the basis of the susceptibility is related to the disruption or aberrant expression of any genes in the region or elsewhere in the genome. Ghoussaini et al. ( 5 ) addressed these issues by genotyping nine SNPs from the 8q24 region in prostate, breast, colorectal, and ovarian cancer subjects and controls. After examining haplotype blocks and by estimating odds ratios for different cancers, they proposed that at least five independent loci are within this region. Four loci were site specific (ie, they were associated with increased risk for a cancer at a single site), but one locus, marked by the rs6983267 SNP, was associated with increased risk of prostate, colorectal, and ovarian cancers. In previous studies, the locus was not associated with breast or endometrial cancer or chronic lymphocytic leukemia ( 5 , 6 ).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,005 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».