Genomic alterations link Rho family of GTPases to the highly invasive phenotype of pancreas cancer
Notice bibliographique
Résumé
Pancreas ductal adenocarcinoma (PDAC) is a highly lethal cancer that typically presents as advanced, unresectable disease. This invasive tendency, coupled with intrinsic resistance to standard therapies and genome instability, are major contributors to poor long-term survival. The genetic elements governing the invasive propensity of PDAC have not been well elucidated. Here, in the course of validating resident genes in highly recurrent and focal amplifications in PDAC, we have identified Rio Kinase 3 (RIOK3) as an amplified gene that alters cytoskeletal architecture as well as promotes pancreatic ductal cell migration and invasion. We determined that RIOK3 promotes its invasive activities through activation of the small G protein, Rac. This genomic and functional link to Rac signaling prompted a genome wide survey of other components of the Rho family network, revealing p21 Activated Kinase 4 (PAK4) as another amplified gene in PDAC tumors and cell lines. Like RIOK3, PAK4 promotes pancreas ductal cell motility and invasion. Together, the genomic and functional profiles establish the Rho family GTP-binding proteins as integral to the hallmark invasive nature of this lethal disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».