Microbial diversity associated with a <i>Paralvinella sulfincola</i> tube and the adjacent substratum on an active deep‐sea vent chimney
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT An extensive survey of the bacterial and archaeal phylogenetic diversity associated with a Paralvinella sulfincola tube and the adjacent substratum was conducted. Phylogenetic groups characterized by anaerobic and/or microaerophilic mesophiles dominated the bacterial 16S rDNA libraries (ɛ‐group F, Sulfurospirillum‐group, δ‐Proteobacteria). The two libraries also contained groups with thermophilic lifestyles (ɛ‐group D, Caldithrix‐group), groups comprising species with various phenotypes (ɛ‐group B, green non‐sulfur bacteria), and a group without cultured representative (ɛ‐group C). Archaeal 16S rDNA libraries from both samples were dominated by the novel lineage DHVE 9, and contained members of the uncultured group DHVE 3, as well as anaerobic hyperthermophiles from the families Thermofilaceae and Thermococcaceae. These results suggest the presence of mostly mesophilic and low oxygen conditions on the chimney surface, which is in accordance with descriptions of P. sulfincola's habitat conditions. Although limited by the lack of replicates, our data on the P. sulfincola tube were compared to available data on the microbial communities associated with secretions from other deep‐sea vent polychaetes.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».