MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2150427485 · doi:10.1042/bj20110461

Targeting the regulation of CFTR channels

2011· letter· en· W2150427485 sur OpenAlexafffund
Paul D. W. Eckford, Christine E. Bear

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2011
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPDZ domainCell biologyCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorScaffold proteinInteractomeTransmembrane proteinBiologyProtein–protein interactionChemistrySignal transductionCystic fibrosisReceptorBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this issue of the Biochemical Journal, Zhang et al. reveal a new strategy for modifying the regulated function of CFTR (cystic fibrosis transmembrane conductance regulator) on the apical surface of epithelial cells. Simply stated, these authors tested the idea that the cAMP-dependent channel activity of CFTR could be effectively enhanced by disruption of a protein-protein interaction which is normally inhibitory for the production of cAMP. This particular protein-protein interaction [between the PDZ motif of LPA2 (type 2 lysophosphatidic acid receptor) and the scaffold protein Nherf2 (Na+/H+ exchanger regulatory factor 2)] is localized in the CFTR interactome on the apical membrane of epithelial cells. Hence disruption of the LPA2-Nherf2 interaction should lead to a localized elevation in cAMP and, consequently, increased cAMP-dependent CFTR activity on the surface of epithelial cells. Zhang et al. confirmed these expectations for a small-molecule compound targeting the LPA2-Nherf2 interaction using relevant cultures and tissues thought to model the human respiratory epithelium. The success of this strategy depended on previous knowledge regarding the role for multiple PDZ-motif-mediated interactions in signalling (directly or indirectly) to CFTR. Given the number and diversity of such PDZ-mediated interactions, future structural and computational studies will be essential for guiding the design of specific pharmacological interventions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0070,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,268 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiochemical JournalMême sujetCystic Fibrosis Research AdvancesTravaux en français237 207