Nascent DNA Synthesis During Homologous Recombination Is Synergistically Promoted by the Rad51 Recombinase and DNA Homology
Notice bibliographique
Résumé
In this study, we exploited a plasmid-based assay that detects the new DNA synthesis (3' extension) that accompanies Rad51-mediated homology searching and strand invasion steps of homologous recombination to investigate the interplay between Rad51 concentration and homology length. Mouse hybridoma cells that express endogenous levels of Rad51 display an approximate linear increase in the frequency of 3' extension for homology lengths of 500 bp to 2 kb. At values below ∼500 bp, the frequency of 3' extension declines markedly, suggesting that this might represent the minimal efficient processing segment for 3' extension. Overexpression of wild-type Rad51 stimulated the frequency of 3' extension by ∼3-fold for homology lengths <900 bp, but when homology was >2 kb, 3' extension frequency increased by as much as 10-fold. Excess wild-type Rad51 did not increase the average 3' extension tract length. Analysis of cell lines expressing N-terminally FLAG-tagged Rad51 polymerization mutants F86E, A89E, or F86E/A89E established that the 3' extension process requires Rad51 polymerization activity. Mouse hybridoma cells that have reduced Brca2 (Breast cancer susceptibility 2) due to stable expression of small interfering RNA show a significant reduction in 3' extension efficiency; expression of wild-type human BRCA2, but not a BRCA2 variant devoid of BRC repeats 1-8, rescues the 3' extension defect in these cells. Our results suggest that increased Rad51 concentration and homology length interact synergistically to promote 3' extension, presumably as a result of enhanced Brca2-mediated Rad51 polymerization.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».