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Enregistrement W2150505604

De-regressing MACE versus domestic EBV for genomics

2015· article· en· W2150505604 sur OpenAlexaffabout
P G Sullivan, J. Jamrozik, G.J. Kistemaker

Notice bibliographique

RevueBulletin - International Bull Evaluation Service/Interbull bulletin · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensCanadian Dairy Commission
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMaceTraitBiologyRegressionAnimal scienceStatisticsMathematicsInternal medicineMedicineComputer science
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

De-regressed EBV are commonly used phenotypes in national genomic evaluation systems.  This study compared REML estimates of variance for de-regressed MACE proofs of foreign sires on the Canadian scale, versus de-regressed national EBV of domestic sires.  Variances for nearly all traits were higher for foreign than domestic sires.  Ratios of SD for foreign relative to domestic sires, based on December 2010 Holstein data were; 1.05 and 1.07 for protein and fat yields, 1.17, 1.04 and 1.24 for mammary system, feet & legs and conformation, 1.50 for cow survival and 1.20 for cow non-return rate.  Based on current data from December 2014, some of the more extreme ratios of SD were closer but still higher than 1.  After applying a variance adjustment to de-regressed MACE proofs of foreign sires, genomic validation results improved for all traits.  Slopes of regression, of the 2014 Canadian LPI index of trait EBV, on the 2010 genomic-enhanced parent averages (GPA), increased from 0.93 to 0.97, and biases of over-prediction for top young genomic bulls were accordingly reduced.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,228
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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