Quantifying cell division with deuterated water and multi‐isotope imaging mass spectrometry (MIMS)
Notice bibliographique
Résumé
Cell division is commonly quantified by the administration of nucleotide labels that are incorporated by the nucleotide salvage pathway. A new approach uses precursors of the de novo nucleotide synthesis pathway, such as labeled water or glucose. Because such precursors are not specific for DNA synthesis, studies utilizing this approach have analyzed isolated genomic DNA to exclude nonspecific background labeling. We hypothesized that pulse‐chase administration of stable isotope labeled water would result in sufficient nuclear labeling to enable discrimination of recently divided cells by quantitative ion microscopy. We administered deuterated (D)‐water and 15 N‐thymidine to mice concurrently, guided by the rationale that 15 N‐thymidine incorporation would serve as a ‘gold standard’ to identify dividing cells. We show both qualitatively and quantitatively that dividing cells in the small intestine ( 15 N‐labeled) demonstrate a discernable D‐signal in the nucleus not observed in undivided cells ( 15 N‐unlabled). Correlation with 31 P − and 12 C 15 N − : 12 C 14 N − images demonstrate preferential localization of 2 H labeling in regions of the nucleus with high DNA content as expected of labeling being incorporated during DNA synthesis and cell division. These data support the concept that stable isotope tagged precursors of the de novo nucleotide synthesis pathway can be used in concert with NanoSIMS to study cell division in vivo . A major implication of this study then is the possibility of using stable isotope tagged water and MIMS to study human cell turnover. Copyright © 2014 John Wiley & Sons, Ltd.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».