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Enregistrement W2150507590 · doi:10.1002/sia.5581

Quantifying cell division with deuterated water and multi‐isotope imaging mass spectrometry (MIMS)

2014· article· en· W2150507590 sur OpenAlexaff
Matthew L. Steinhauser, Christelle Guillermier, Mei Wang, C. Lechène

Notice bibliographique

RevueSurface and Interface Analysis · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensIONICS Mass Spectrometry (Canada)
Organismes subventionnairesEllison Medical FoundationNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Center for Research ResourcesHarvard Stem Cell InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésNucleotideChemistryCell divisionThymidineDNADNA synthesisIsotopeIsotopic labelingCellStable isotope ratioBiochemistryStable-isotope probingBiophysicsBiologyGeneticsGeneBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell division is commonly quantified by the administration of nucleotide labels that are incorporated by the nucleotide salvage pathway. A new approach uses precursors of the de novo nucleotide synthesis pathway, such as labeled water or glucose. Because such precursors are not specific for DNA synthesis, studies utilizing this approach have analyzed isolated genomic DNA to exclude nonspecific background labeling. We hypothesized that pulse‐chase administration of stable isotope labeled water would result in sufficient nuclear labeling to enable discrimination of recently divided cells by quantitative ion microscopy. We administered deuterated (D)‐water and 15 N‐thymidine to mice concurrently, guided by the rationale that 15 N‐thymidine incorporation would serve as a ‘gold standard’ to identify dividing cells. We show both qualitatively and quantitatively that dividing cells in the small intestine ( 15 N‐labeled) demonstrate a discernable D‐signal in the nucleus not observed in undivided cells ( 15 N‐unlabled). Correlation with 31 P − and 12 C 15 N − : 12 C 14 N − images demonstrate preferential localization of 2 H labeling in regions of the nucleus with high DNA content as expected of labeling being incorporated during DNA synthesis and cell division. These data support the concept that stable isotope tagged precursors of the de novo nucleotide synthesis pathway can be used in concert with NanoSIMS to study cell division in vivo . A major implication of this study then is the possibility of using stable isotope tagged water and MIMS to study human cell turnover. Copyright © 2014 John Wiley & Sons, Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,174
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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