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Enregistrement W2150603220 · doi:10.1099/mic.0.056119-0

NhaP1 is a K+(Na+)/H+ antiporter required for growth and internal pH homeostasis of Vibrio cholerae at low extracellular pH

2012· article· en· W2150603220 sur OpenAlexafffund
Matthew J. Quinn, Craig Resch, Jonathan Sun, Erin J. Lind, Pavel Dibrov, Claudia C. Häse

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVibrio bacteria research studies
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésAntiporterVibrio choleraeEscherichia coliExtracellularBiochemistryCytosolHomeostasisBiologyIntracellular pHVesicleOsmotic pressureSodiumChemistryBiophysicsBacteriaCell biologyEnzymeMembraneGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Vibrio cholerae has adapted to a wide range of salinity, pH and osmotic conditions, enabling it to survive passage through the host and persist in the environment. Among the many proteins responsible for bacterial survival under these diverse conditions, we have identified Vc-NhaP1 as a K(+)(Na(+))/H(+) antiporter essential for V. cholerae growth at low environmental pH. Deletion of the V. cholerae nhaP1 gene caused growth inhibition when external potassium was either limited (100 mM and below) or in excess (400 mM and above). This growth defect was most apparent at mid-exponential phase, after 4-6 h of culture. Using a pH-sensitive GFP, cytosolic pH was shown to be dependent on K(+) in acidic external conditions in a Vc-NhaP1-dependent manner. When functionally expressed in an antiporterless Escherichia coli strain and assayed in everted membrane vesicles, Vc-NhaP1 operated as an electroneutral alkali cation/proton antiporter, exchanging K(+) or Na(+) ions for H(+) within a broad pH range (7.25-9.0). These data establish the putative V. cholerae NhaP1 protein as a functional K(+)(Na(+))/H(+) antiporter of the CPA1 family that is required for bacterial pH homeostasis and growth in an acidic environment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,797

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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