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Enregistrement W2150618856 · doi:10.1186/1476-4598-9-173

Identification and characterization of retinoblastoma gene mutations disturbing apoptosis in human breast cancers

2010· article· en· W2150618856 sur OpenAlexaff
Elisabet O. Berge, Stian Knappskog, Stephanie Geisler, Vidar Staalesen, Marec Pacal, Anne‐Lise Børresen‐Dale, Pål Puntervoll, Johan R. Lillehaug, Per Eystein Lønning

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesHaukeland UniversitetssjukehusKreftforeningen
Mots-clésBiologyPoint mutationGermline mutationCancer researchRetinoblastoma proteinMutationExonBreast cancerTumor suppressor geneGeneticsRetinoblastomaGeneSomatic cellCancerCell cycleMolecular biologyCarcinogenesis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The tumor suppressor pRb plays a key role regulating cell cycle arrest, and disturbances in the RB1 gene have been reported in different cancer forms. However, the literature reports contradictory findings with respect to a pro--versus anti--apoptotic role of pRb, and the consequence of alterations in RB1 to chemotherapy sensitivity remains unclear. This study is part of a project investigating alterations in pivotal genes as predictive factors to chemotherapy sensitivity in breast cancer. RESULTS: Analyzing 73 locally advanced (stage III) breast cancers, we identified two somatic and one germline single nucleotide changes, each leading to amino acid substitution in the pRb protein (Leu607Ile, Arg698Trp, and Arg621Cys, respectively). This is the first study reporting point mutations affecting RB1 in breast cancer tissue. In addition, MLPA analysis revealed two large multiexon deletions (exons 13 to 27 and exons 21 to 23) with the exons 21-23 deletion occurring in the tumor also harboring the Leu607Ile mutation. Interestingly, Leu607Ile and Arg621Cys point mutations both localize to the spacer region of the pRb protein, a region previously shown to harbor somatic and germline mutations. Multiple sequence alignment across species indicates the spacer to be evolutionary conserved. All three RB1 point mutations encoded nuclear proteins with impaired ability to induce apoptosis compared to wild-type pRb in vitro. Notably, three out of four tumors harboring RB1 mutations displayed primary resistance to treatment with either 5-FU/mitomycin or doxorubicin while only 14 out of 64 tumors without mutations were resistant (p = 0.046). CONCLUSIONS: Although rare, our findings suggest RB1 mutations to be of pathological importance potentially affecting sensitivity to mitomycin/anthracycline treatment in breast cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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