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Enregistrement W2150688669 · doi:10.1200/jco.2007.12.0352

Three-Gene Prognostic Classifier for Early-Stage Non–Small-Cell Lung Cancer

2007· article· en· W2150688669 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene expression and cancer classification
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineOncologyInternal medicineConcordanceLung cancerMicroarrayHazard ratioTaqManGeneGene expressionReal-time polymerase chain reactionBiologyConfidence interval

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Several microarray studies have reported gene expression signatures that classify non-small-cell lung carcinoma (NSCLC) patients into different prognostic groups. However, the prognostic gene lists reported to date overlap poorly across studies, and few have been validated independently using more quantitative assay methods. PATIENTS AND METHODS: The expression of 158 putative prognostic genes identified in previous microarray studies was analyzed by reverse transcription quantitative polymerase chain reaction in the tumors of 147 NSCLC patients. Concordance indices and risk scores were used to identify a stage-independent set of genes that could classify patients with significantly different prognoses. RESULTS: We have identified a three-gene classifier (STX1A, HIF1A, and CCR7) for overall survival (hazard ratio = 3.8; 95% CI, 1.7 to 8.2; P < .001). The classifier was also able to stratify stage I and II patients and further improved the predictive ability of clinical factors such as histology and tumor stage. The predictive value of this three-gene classifier was validated in two large independent microarray data sets from Harvard and Duke Universities. CONCLUSION: We have identified a new three-gene classifier that is independent of and improves on stage to stratify early-stage NSCLC patients with significantly different prognoses. This classifier may be tested further for its potential value to improve the selection of resected NSCLC patients in adjuvant therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,489
Score d'incertitude au seuil0,458

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,094
Tête enseignante GPT0,441
Écart entre enseignants0,347 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle