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Enregistrement W2150740969 · doi:10.1139/v02-132

An effective strategy for structural elucidation of oligosaccharides through NMR spectroscopy combined with peracetylation using doubly <sup>13</sup>C-labeled acetyl groups

2002· article· en· W2150740969 sur OpenAlexvenueno aff
Brad Bendiak, Tammy T. Fang, David N. M. Jones

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteMizutani Foundation for Glycoscience
Mots-clésChemistryGlycosidic bondNuclear magnetic resonance spectroscopyCarbohydrate conformationRing (chemistry)SpectroscopyMonosaccharideDephasingStereochemistryComputational chemistryNuclear magnetic resonanceOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The use of NMR spectroscopy for the elucidation of larger carbohydrate structures isolated from natural sources is principally limited by severe overlap of 1 H signals, poor sensitivity when experiments involve 13 C nuclei, and difficulties in conclusively establishing linkage positions. Peracetylation of oligosaccharides with doubly 13 C-labeled acetyl groups provides several major advantages for their structural elucidation when combined with specifically tailored NMR pulse sequences. The 2.5–4.7 Hz J-coupling constants between acetyl carbonyl- 13 C nuclei and protons of the sugar ring at the sites of acetylation enables these sites to be readily assigned. By inference, glycosidic linkage positions on monosaccharides can be unambiguously determined. This can be used in lieu of permethylation analysis, yet does not require degradation of oligosaccharides. Spectral dispersion in the directly detected ( 1 H) dimension is increased ~2.6–2.7-fold due to the downfield shifting of sugar-ring protons at the positions of acetylation. Peracetylation also introduces three new frequency dimensions for NMR studies, namely the 13 CO, 13 C Me , and 1 H Me frequencies of the acetyl groups. These frequencies can be correlated to sugar protons, either independently or in combination, in alternative 2-, 3-, or 4-D experiments. The use of Hartmann–Hahn coherence transfer combined with zero-quantum dephasing periods permits purely absorptive in-phase multiplets to be extracted and enables accurate scalar couplings between ring protons to be measured, even in multidimensional experiments. Results are illustrated on a nonasaccharide-alditol derived from N-linked glycoproteins and on some smaller structures containing sialic acids and N-acetylhexosamines. Methods for small-scale sample acetylation using the superacylation catalyst, 4-dimethylamino pyridine, are described. A brief historical perspective pertinent to the fundamental contributions of Dr. R.U. Lemieux to the field of carbohydrate NMR is also presented.Key words: NMR, oligosaccharides, peracetylation, doubly 13 C-labeled acetyl groups, tailored pulse sequences, heteronuclear Hartmann–Hahn.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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