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Enregistrement W2150752820 · doi:10.1056/nejmoa1102903

Recurrent Somatic<i>DICER1</i>Mutations in Nonepithelial Ovarian Cancers

2011· article· en· W2150752820 sur OpenAlex
Alireza Heravi‐Moussavi, Michael S. Anglesio, Siwei Cheng, Janine Senz, Winnie Yang, Leah Prentice, Anthony P. Fejes, Christine Chow, Alicia Tone, Steve E. Kalloger, Nancy Hamel, Andrew Roth, Gavin Ha, Adrian Wan, Sarah Maines‐Bandiera, Clara Salamanca, Barbara Pasini, Blaise Clarke, Anna F. Lee, Cheng‐Han Lee, Chengquan Zhao, Robert H. Young, Samuel Aparício, Poul H. Sorensen, Michelle M.M. Woo, Niki Boyd, Steven J.M. Jones, Martin Hirst, Marco A. Marra, C. Blake Gilks, Sohrab P. Shah, William D. Foulkes, Gregg B. Morin, David G. Huntsman

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueNew England Journal of Medicine · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCongenital Diaphragmatic Hernia Studies
Établissements canadiensJewish General HospitalUniversity of TorontoMcGill UniversityOccupational Cancer Research CentreVancouver General HospitalUniversity of British ColumbiaBC Cancer AgencyMcGill University Health CentreCanada's Michael Smith Genome Sciences Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGermlineGermline mutationCancer researchSomatic cellMissense mutationGerm cell tumorsBiologyMutationRNase PGeneticsMolecular biologyGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Germline truncating mutations in DICER1, an endoribonuclease in the RNase III family that is essential for processing microRNAs, have been observed in families with the pleuropulmonary blastoma-family tumor and dysplasia syndrome. Mutation carriers are at risk for nonepithelial ovarian tumors, notably sex cord-stromal tumors. METHODS: We sequenced the whole transcriptomes or exomes of 14 nonepithelial ovarian tumors and noted closely clustered mutations in the region of DICER1 encoding the RNase IIIb domain of DICER1 in four samples. We then sequenced this region of DICER1 in additional ovarian tumors and in certain other tumors and queried the effect of the mutations on the enzymatic activity of DICER1 using in vitro RNA cleavage assays. RESULTS: DICER1 mutations in the RNase IIIb domain were found in 30 of 102 nonepithelial ovarian tumors (29%), predominantly in Sertoli-Leydig cell tumors (26 of 43, or 60%), including 4 tumors with additional germline DICER1 mutations. These mutations were restricted to codons encoding metal-binding sites within the RNase IIIb catalytic centers, which are critical for microRNA interaction and cleavage, and were somatic in all 16 samples in which germline DNA was available for testing. We also detected mutations in 1 of 14 nonseminomatous testicular germ-cell tumors, in 2 of 5 embryonal rhabdomyosarcomas, and in 1 of 266 epithelial ovarian and endometrial carcinomas. The mutant DICER1 proteins had reduced RNase IIIb activity but retained RNase IIIa activity. CONCLUSIONS: Somatic missense mutations affecting the RNase IIIb domain of DICER1 are common in nonepithelial ovarian tumors. These mutations do not obliterate DICER1 function but alter it in specific cell types, a novel mechanism through which perturbation of microRNA processing may be oncogenic. (Funded by the Terry Fox Research Institute and others.).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,828
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle