ERG–SOX4 interaction promotes epithelial–mesenchymal transition in prostate cancer cells
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Approximately 50% of prostate cancer (PCa) patients in Western countries harbor ERG rearrangement with concurrent ERG overexpression. Overexpression of SOX4 has been shown to play important roles in multiple cancers including PCa. However, the link between these two critical genetic aberrations was unclear. METHODS: Fluorescence in situ hybridization and immunohistochemistry were utilized to detect ERG rearrangement and SOX4 expression. Cellular function was evaluated by transwell, wound healing assays, and cell adhesion assay, respectively. Interaction between ERG and SOX4 was arrayed by co-immunoprecipitation, Real-time PCR, Western blot, and siRNA. Direct binding of ERG to the promoter of SOX4, as well as epigenetic modifications of their promoters after TGF-β1 treatment was monitored by chromatin immunoprecipitation. RESULTS: ERG regulated SOX4 expression via binding to its promoter. Silencing both of them showed duplicate effects on restoring the epithelial characteristics, increasing cellular adhesion and decreasing capacity of cellular migration and invasion. ERG and SOX4 have cooperative roles in TGF-β1-induced epithelial to mesenchymal transition (EMT) process. In addition, TGF-β1 stimulation increased levels of chromatin marks associated with active genes (H3K4me3, H416ac), and decreased levels of repressive marks (H3K27me3) at their promoters. 5-aza and TSA treatment changed expressions of ERG and SOX4. Clinically, overexpression of SOX4 is associated with ERG rearrangement status in PCa and ERG+/SOX4+ defined a subset of PCa patients with poor prognosis. CONCLUSION: Our findings define a key role for ERG/SOX4 in the development of a subset of PCa and highlight the clinical importance of identifying molecularly defined tumor subgroups.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».