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Enregistrement W2150821171 · doi:10.1139/w04-082

Pheno and genotyping of<i>Staphylococcus aureus</i>, isolated from bovine milk samples from São Paulo State, Brazil

2004· article· en· W2150821171 sur OpenAlexvenueno aff
K G Cabral, C. Lämmler, M. Zschöck, Hélio Langoni, Masiukova Sa, Cassiano Victória, Aristeu Vieira da Silva

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDeutscher Akademischer Austauschdienst
Mots-clésStaphylococcus aureusGenotypingMicrobiologyBovine milkBiologyVirologyFood scienceGenotypeGeneticsBacteriaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In the present study, 87 Staphylococcus aureus isolates obtained from milk samples of 87 cows with mastitis in 6 different municipal districts of 2 regions of Sao Paulo State, Brazil, were compared pheno- and genotypically. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) analysis of the strains was performed, and PCR was carried out to detect genes for a number of staphylococcal cell surface proteins, exoproteins, and 3 classes of agr genes. Nine distinct S. aureus lineages (LA-LI) were identified by PFGE. The lineages LA and LE, which accounted together for 63 strains (72.2%), were prevalent and had been collected from all of the 6 municipal districts, indicating a broad geographic distribution of these lineages; LB, LC, LD, LF, LG, LH, and LI, however, were isolated sporadically and accounted for 24 strains (27.8%). Some characteristics, like penicillin resistance and the presence of cap8 and agr class II genes, were associated with the prevalent lineages (LA and LE), and penicillin susceptibility and the presence of cna and cap5 genes were associated with sporadic lineages. According to the present results, some S. aureus lineages possess a combination of genes that confer the propensity to cause and disseminate infection, and only a limited number of clones are responsible for the cases of bovine mastitis on the various farms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,407
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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