MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2150845593 · doi:10.1095/biolreprod.102.009076

Novel RING Finger Protein OIP1 Binds to Conserved Amino Acid Repeats in Sperm Tail Protein ODF11

2003· article· en· W2150845593 sur OpenAlexafffund
Heather A. Zarsky, Min Cheng, Frans A. van der Hoorn

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSperm and Testicular Function
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyLeucine zipperPolyadenylationConserved sequenceZinc fingerCell biologyAlternative splicingGeneticsRNA splicingExonPeptide sequenceMolecular biologyGeneTranscription factorMessenger RNARNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Outer dense fibers (ODFs) and the fibrous sheath (FS) are unique structures of the mammalian sperm tail. Recently, progress has been made in the molecular cloning of ODF and FS proteins, and because of this, questions addressing the morphogenesis and underlying protein network that make up sperm tail structures and their function can now be addressed. Using the N-terminal leucine zipper motif of the major ODF protein ODF1, we had previously isolated interacting proteins Odf2, Spag4, and Spag5. We report here a yeast two-hybrid strategy to isolate a novel rat testicular protein, OIP1, that binds to the evolutionarily conserved Cys-Gly-Pro repeats in the C-terminus of ODF1. OIP1 is expressed in round spermatids as well as in spermatocytes and several somatic tissues, albeit at a lower level. No expression was detectable in epididymis, heart, and smooth muscle. OIP1 protein localizes to the sperm tail in a pattern expected for an ODF1-interacting protein. OIP1 belongs to the family of RING finger proteins of the H2 subclass. Deletion of the putative RING motif significantly decreased binding to ODF1. Genomic analysis of rat Oip1 and Oip1 homologs indicates that Oip1 is highly conserved. Oip1 is subject to differential splicing and alternative polyadenylation events. It is interesting that Oip1 mRNAs have been reported that lack the exon encoding the putative RING finger.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,031
Score d'incertitude au seuil0,569

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2003
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiology of ReproductionMême sujetSperm and Testicular FunctionTravaux en français237 207