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Enregistrement W2150875162 · doi:10.7150/ijbs.8.171

The Murine Caecal MicroRNA Signature Depends on the Presence of the Endogenous Microbiota

2012· article· en· W2150875162 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Biological Sciences · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanada Research Chairs
Mots-clésmicroRNABiologyGene expressionBarrier functionGeneRegulation of gene expressionEndogenyGut floraFunction (biology)Cell biologyGene expression profilingDNA microarrayMucin 2GeneticsImmunologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The intestinal messenger RNA expression signature is affected by the presence and composition of the endogenous microbiota, with effects on host physiology. The intestine is also characterized by a distinctive micronome. However, it is not known if microbes also impact intestinal gene expression epigenetically. We investigated if the murine caecal microRNA expression signature depends on the presence of the microbiota, and the potential implications of this interaction on intestinal barrier function. Three hundred and thirty four microRNAs were detectable in the caecum of germ-free and conventional male mice and 16 were differentially expressed, with samples from the two groups clustering separately based on their expression patterns. Through a combination of computational and gene expression analyses, including the use of our curated list of 527 genes involved in intestinal barrier regulation, 2,755 putative targets of modulated microRNAs were identified, including 34 intestinal barrier-related genes encoding for junctional and mucus layer proteins and involved in immune regulation. This study shows that the endogenous microbiota influences the caecal microRNA expression signature, suggesting that microRNA modulation is another mechanism through which commensal bacteria impact the regulation of the barrier function and intestinal homeostasis. Through microRNAs, the gut microbiota may impinge a much larger number of genes than expected, particularly in diseases where its composition is altered. In this perspective, abnormally expressed microRNAs could be considered as novel therapeutic targets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,106
Score d'incertitude au seuil0,247

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,277
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle