Evolution of two Rh blood group-related genes of the amphioxus species Branchiostoma floridae
Notice bibliographique
Résumé
We determined cDNAs of two genes that belong to the Rhesus (Rh) blood group gene family in an amphioxus species (Branchiostoma floridae) and designated them Rh-related-1 (RhR-1) and Rh-related-2 (RhR-2). RhR-1 and RhR-2 consisted of 10 and 11 exons, respectively. 3' UTR sequences of RhR-1 were shorter (220-272 bp) than those of RhR-2 (1,505-1,650 bp). CDS lengths were 1,344 and 1,476 bp for RhR-1 and RhR-2, respectively, and the average nucleotide difference between their CDS regions was 0.33. The corresponding regions of Rh genes from exons 2 to 7 were relatively conserved among the chordate species examined in this study. Length difference numbers were in multiples of three, which implies that codon frames were conserved among them, and the same exon/intron boundary phases were observed in those regions. This region was used for the phylogenetic analyses. RhR-1 and RhR-2 formed a cluster on the phylogenetic tree of the Rh gene family. Gene duplication time of RhR-1 and RhR-2 was estimated to be ca. 500 million years ago. It is likely that the four Rh family genes in vertebrates emerged by gene duplications in the common ancestor of vertebrates, and functional differentiation has occurred after the first gene duplication.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».