Mutations that impair interaction properties of TRIM32 associated with limb-girdle muscular dystrophy 2H
Notice bibliographique
Résumé
TRIM32 belongs to a large family of proteins characterized by a tripartite motif, possibly involved in the ubiquitination process, acting as an E3 ligase. In addition, TRIM32 has six NHL repeats with putative interaction properties. A homozygous mutation at the third NHL repeat (D487N) has been found in patients with limb girdle muscular dystrophy 2H (LGMD2H). This mutation was only identified in the inbred Manitoba Hutterite or their descendants. Interestingly, a mutation in the B-box domain of TRIM32 cosegregates with Bardet-Biedl syndrome type 11 (BBS11). The signs of BBS11 include obesity, pigmentary and retinal malformations, diabetes, polydactyly, and no muscular dystrophy, suggesting an alternative disease mechanism. We aim to ascertain whether D487N is the only pathological LGMD2H allele, limited to Hutterites. We studied the TRIM32 gene in 310 LGMD patients with no mutations at the other known loci. We identified four patients with novel mutated alleles. Two mutations were homozygous and missing in controls. These mutations also clustered at the NHL domain, suggesting that a specific (interaction) property might be abolished in LGMD2H patients. No mutations were found at the B-box region where the BBS11 mutation is found. We tested TRIM32 and its mutants by yeast-two-hybrid assay, developing an interaction test to validate mutations. All LGMD2H mutants, but not the BBS11, lost their ability to self-interact. The interaction of TRIM32 mutants with E2N, a protein involved in the ubiquitination process, was similarly impaired. In conclusion, the mutations here reported may cause muscular dystrophy by affecting the interaction properties of TRIM32.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».