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Enregistrement W2151001058 · doi:10.1158/0008-5472.can-09-4120

FOXC1 Is a Potential Prognostic Biomarker with Functional Significance in Basal-like Breast Cancer

2010· article· en· W2151001058 sur OpenAlexaff
Partha Ray, Jinhua Wang, Ying Qu, Myung‐Shin Sim, Jaime Shamonki, Sanjay P. Bagaria, Xing Ye, Bingya Liu, David Elashoff, Dave S.�B. Hoon, Michael A. Walter, John W.M. Martens, Andrea L. Richardson, Armando E. Giuliano, Xiaojiang Cui

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesSusan G. KomenSusan G. Komen for the Cure
Mots-clésBreast cancerMedicineOncologyBiomarkerGene knockdownInternal medicineLymph nodeCancerMetastasisEctopic expressionCancer researchCA15-3ImmunohistochemistryBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gene expression signatures for a basal-like breast cancer (BLBC) subtype have been associated with poor clinical outcomes, but a molecular basis for this disease remains unclear. Here, we report overexpression of the transcription factor FOXC1 as a consistent feature of BLBC compared with other molecular subtypes of breast cancer. Elevated FOXC1 expression predicted poor overall survival in BLBC (P = 0.0001), independently of other clinicopathologic prognostic factors including lymph node status, along with a higher incidence of brain metastasis (P = 0.02) and a shorter brain metastasis-free survival in lymph node-negative patients (P < 0.0001). Ectopic overexpression of FOXC1 in breast cancer cells increased cell proliferation, migration, and invasion, whereas shRNA-mediated FOXC1 knockdown yielded opposite effects. Our findings identify FOXC1 as a theranostic biomarker that is specific for BLBC, offering not only a potential prognostic candidate but also a potential molecular therapeutic target in this breast cancer subtype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations233
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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