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Enregistrement W2151091988 · doi:10.1034/j.1399-3054.2002.1150106.x

Adenine phosphoribosyltransferase isoforms of <i>Arabidopsis</i> and their potential contributions to adenine and cytokinin metabolism

2002· article· en· W2151091988 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePhysiologia Plantarum · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Molecular Research
Établissements canadiensQueen's UniversityUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésGene isoformCytosolBiochemistryAdenine phosphoribosyltransferaseEnzymeNucleotideArabidopsisCytokininChemistryBiologyGeneAuxin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Adenine phosphoribosyltransferase (APT; EC 2.4.2.7) is a constitutively expressed enzyme involved in the one-step salvage of adenine to AMP. The Arabidopsis thaliana genome contains five sequences annotated as encoding APT or APT-like enzymes. Three of these have now been cloned, over-expressed and compared using kinetic analyses. At a cytosolic pH, all bind adenine efficiently based on their Km values (0.8-2.6 &mgr;M), although APT1 metabolizes adenine at a rate 31-53 times faster than APT2 and APT3, respectively. Since APT also has a possible role in the interconversion of cytokinin bases to nucleotides, we characterized the activity of each isoform on zeatin, isopentenyladenine and benzyladenine. Based on their Km values, APT2 and APT3 had much higher affinities than APT1 for all three cytokinins (15-440 &mgr;M for APT2 and 3 vs. 1.8-2.5 mM for APT1); conversely the Vmax values for APT2 and APT3 on these CK substrates showed the opposite trend, being 4- to 19-fold lower than those of APT1. Anti-peptide antibodies for APT1, APT2, and APT3 were prepared and used to examine the subcellular localization of each isoform. Based on these results, APT1 and APT3 appear to be cytosolic, while the localization of APT2 was inconclusive although sequence analysis implies that APT2 is also cytosolic. Each isoform was modelled against the crystal structure of APT from Leishmania donovani, and structural differences in substrate specificity-determining domains have been found. The estimated kinetic activities of these APTs suggest that they contribute primarily to adenine recycling, although an involvement in cytokinin interconversion cannot be discounted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,588

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle